در مدیریت فناوری اطلاعات، مهمترین چالش، تطابق با تغییرات و نوآوری‌های روزانه در فناوری است. برای مقابله با این چالش، مدیران باید به‌روزرسانی دائمی دانش خود را با روش‌ها و فنون جدید مدیریت فناوری اطلاعات انجام دهند.

همچنین، برای مدیریت فناوری اطلاعات در سازمان‌ها، ارتباط نزدیک با سایر بخش‌های سازمانی بسیار حائز اهمیت است. مدیران باید با بخش‌های مختلف سازمان، از جمله بازاریابی، مالی، تولید و... هماهنگی لازم را داشته باشند تا بتوانند بهترین استراتژی‌ها را برای مدیریت فناوری اطلاعات در سازمان تدوین کنند.

به طور کلی، مدیریت فناوری اطلاعات یکی از اصلی‌ترین عوامل در موفقیت سازمان‌هاست و برای دستیابی به این موفقیت، باید تلاشی مداوم برای به‌روزرسانی دانش و هماهنگی با بخش‌های مختلف سازمانی انجام شود. به عنوان مثال، استفاده از نرم‌افزارهای مدیریت پروژه و گزارش‌دهی به‌صورت دوره‌ای، می‌تواند به بهبود مدیریت فناوری اطلاعات در سازمان کمک کند.